Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms