Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD4Q7Z3J3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD4Q7Z3J3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms