Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms