Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD6Q6ZV73 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD6Q6ZV73 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD6Q6ZV73 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms