Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
WDR88Q6ZMY6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms