Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms