Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms