Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms