Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms