Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALS2CLQ60I27 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms