Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms