Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms