Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms