Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms