Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HFEQ30201 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms