Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms