Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CCDC142Q17RM4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CCDC142Q17RM4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CCDC142Q17RM4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CCDC142Q17RM4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CCDC142Q17RM4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CCDC142Q17RM4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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