Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME3Q16798 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ME3Q16798 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ME3Q16798 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ME3Q16798 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ME3Q16798 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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