Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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FOXD1Q16676 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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