Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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