Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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