Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL15Q16663 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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