Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms