Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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