Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms