Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms