Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SF1Q15637 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SF1Q15637 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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