Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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