Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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