Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IHHQ14623 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IHHQ14623 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IHHQ14623 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IHHQ14623 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IHHQ14623 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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