Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms