Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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