Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ITGA9Q13797 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ITGA9Q13797 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ITGA9Q13797 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ITGA9Q13797 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA9Q13797 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ITGA9Q13797 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ITGA9Q13797 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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