Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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