Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PEX6Q13608 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PEX6Q13608 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PEX6Q13608 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PEX6Q13608 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PEX6Q13608 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PEX6Q13608 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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