Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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