Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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