Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPS1Q13098 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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