Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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