Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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