Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRAF2Q12933 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRAF2Q12933 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRAF2Q12933 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRAF2Q12933 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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