Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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