Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms