Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms