Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN11Q06124 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms