Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms