Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREMQ03060 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREMQ03060 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREMQ03060 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms