Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms