Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms