Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms